本作是《宝可梦 金/银》发售一年后推出的资料片。丰富并增加了封面宝可梦水君的剧情。并且是系列首次新增了女性主角。也对地图，宝可梦绘图等细节做了修改。本作是唯一一个日版标题带有“Version”的系列作。