和系列其他作品一样，《太鼓达人 神秘冒险》除了普通的演奏模式，加入了RPG模式，主角将和太鼓“咚酱”、“咔酱”再次踏上大冒险，在旅途中结交新的同伴，一起用音乐和敌人战斗，这次我方可以组建最大8人的战队。《逆转裁判》还和本作展开了联动，成步堂也将成为主角的同伴。