本作是N64主机上的《星际火狐64》的重制版，配合3DS自身裸眼3D的机能，《星际火狐64 3D》表现出了出色的3D立体视效。除此之外，本作还使用到了3DS主机的一些特色机能，比如利用陀螺仪机能来实现画面随晃动来改变可观察的视角。