本作是GBA版的续作，不过剧情上却没有什么太大的联系。在本作中，马里奥兄弟为了拯救碧奇公主将穿越时空回到过去，与小时候的自己一起展开冒险。游戏的最大特色就是需要玩家同时控制大小两对马里奥兄弟，按键操作以及上下屏的显示也会根据情况分别用于两对兄弟的冒险之中，这使得游戏的变化更加丰富。游戏针对NDS的双屏以及四人主角进行了特别的调整，既保留了前作那简单有趣又有一定深度的动作性，又增加了很多全新的玩法。游戏对应专用震动包，令冒险真正“动”了起来。